Советское вторжение в Афганистан вывело холодную войну на новый пик, и в 1984 году в стране появляется одноглазый мужчина с протезом руки. Те, кто его знает, называют его Змеем; легендарный наемник, которого однажды стерла со сцены истории и оставила в коме американская частная разведывательная сеть Cipher. Снейка сопровождает Оцелот, старый друг, который спас его от нападения, когда он наконец проснулся.